JAE Intro 2024 | Hasta el 20/05 | Para grado y máster

Grupo:  Ecofisiología, Biomarcadores y Gestión Sostenible de Bivalvos

Área: Vida  Referencia da oferta: JAEINT24_EX_0701

Contacto: José Babarro

La ostra rizada, Magallana gigas, es una importante especie para la acuicultura que se ha introducido con fines comerciales en un gran número de países en todo el mundo. Cuando se naturaliza, M. gigas puede alcanzar altas densidades y formar arrecifes extensos. Esto puede transformar por completo los hábitats nativos y tener profundos impactos en las comunidades residentes, por lo que los beneficios de la extracción comercial de esta especie pueden ser contrarrestados por su impacto sobre las poblaciones nativas.

En España, la mayor parte de la producción acuícola de M. gigas proviene de Galicia (NO de España), donde la preocupación por su interacción con otras actividades de marisqueo crece progresivamente debido a la expansión de esta especie. Además, se produce una situación peculiar respecto a la capacidad de establecimiento de esta especie entre las Rías del norte (Rías Altas) y las del sur (Rías Baixas). Mientras que las poblaciones naturalizadas se encuentran en las Rías del norte, donde no se lleva a cabo la acuicultura, las del sur, que concentran el sector acuícola de ostra rizada desde los 90s, sólo recientemente han comenzado a registrar asentamiento natural de M. gigas. Estos escenarios contrastantes representan una oportunidad muy interesante para comprender las vías de propagación y sus barreras para esta especie potencialmente invasora.

Dentro del proyecto OYSTER-WATCH se están desarrollando en nuestro grupo de investigación sistemas de monitoreo rápido y preciso de la distribución de la ostra rizada a una elevada escala espacial usando AUVs y algoritmos de IA. De este modo se pretenden desarrollar metodologías de control de la expansión de la especie, que permitan desarrollar herramientas de control eficaces.

La propuesta de formación que se ofrece para la JAE-INTRO, estaría asociada a los resultados de dicho proyecto, pues se propone validar estas nuevas técnicas de monitorización con metodologías clásicas de dinámica de poblaciones (transectos para la estimación de la densidad de adultos y del reclutamiento de nuevos individuos). Este programa formativo, permitirá conocer los pros y contras de las diferentes técnicas de cuantificación de la dinámica poblacional de especies bentónicas con un foco especial en el papel de las especies invasoras.

Requisitos: Requisitos: Las personas solicitantes deben estar cursando un título de Grado o Máster y cumplir con todos los requisitos contemplados en la convocatoria.

Grupo: Inmunología y Genómica

Área: Vida  Referencia da oferta: JAEINT24_EX_1687

Contacto: Antonio Figueras

Se estima que en 2060 se producirán 1000 millones de toneladas de plástico al año. Actualmente son 600 millones de toneladas. Cada año terminan en el mar unas 500.000 toneladas.

Los nanoplásticos son diminutas partículas de plástico menores a 1000 nanómetros. Pueden resultar de la descomposición de objetos plásticos más grandes. Además, algunos productos de consumo, como cosméticos y textiles, contienen nanoplásticos. Su pequeño tamaño las hace fácilmente ingeribles y ser internalizadas por las células produciendo diversos daños en la maquinaria celular.

El mejillón (Mytilus edulis, M. galloprovincialis) es un molusco bivalvo filtrador que se encuentra en todo el mundo. Desempeña un papel crucial en los ecosistemas marinos al filtrar grandes volúmenes de agua para obtener partículas de alimento. Por esto los mejillones pueden acumular contaminantes y partículas presentes en el agua, incluidos microplásticos y nanoplásticos.

La persona seleccionada aprenderá y utilizará las técnicas para determinar daño celular, inflamación, bioacumulación, expresión génica inducida por la exposición a nanoplásticos, impacto sobre respuesta a patógenos.

Además, determinará la capacidad de concentración de plásticos por el mejillón para comprender el proceso de biomagnificación y el posible riesgo para niveles tróficos superiores, incluidos los seres humanos. Usaremos el pez cebra, modelo de enfermedades humanas, para evaluar este aspecto..

 Requisitos: Las personas solicitantes deben estar cursando un título de Grado o Máster y cumplir con todos los requisitos contemplados en la convocatoria.

Grupo: Patobiología Molecular Marina

Área: Vida  Referencia da oferta: JAEINT24_EX_1163

Contacto: Camino Gestal Mateo

La creciente importancia del bienestar de las especies de acuicultura tiene su base tanto en consideraciones éticas como en la necesidad de mejorar la calidad en los productos de acuicultura.

El pulpo común, Octopus vulgaris, es una especie comercialmente importante con un alto potencial para la diversificación de la acuicultura. Para proteger este importante recurso pesquero en Galicia, actualmente sobreexplotado, impulsar la bioeconomía mediante un uso más eficiente de los recursos vivos y abastecer la fuerte demanda del mercado, es necesario desarrollar una acuicultura eficiente y sostenible que garantice el bienestar animal. El pulpo común es además modelo en experimentación animal, lo que requiere su mantenimiento en instalaciones de acuario en buenas condiciones de bienestar y salud. Las condiciones de cautividad y el estrés al que en ocasiones puedan estar sometidos los animales favorecen el desarrollo de enfermedades que deben ser controladas.Por tanto, una de las prioridades como estrategia para mejorar su salud y bienestar en instalaciones de acuarios y /ó cultivo es la prevención de enfermedades y el aumento de su capacidad de lucha contra patógenos y agresiones externas.

El principal objetivo de esta propuesta es pues el desarrollo de metodologías no invasivas para la identificación rápida y fácil de los principales patógenos que puedan afectar a esta especie con objeto de diseñar un plan de seguimiento y vigilancia para su utilización como indicador biológico de bienestar (OWI) en plantas de cultivo de pulpo, que favorezca el diagnóstico temprano y control sanitario, mejorando su salud y evitando enfermedades. Para ello se utilizarán muestras de mucus de piel y branquias, así como heces y filtrados de agua del tanque de mantenimiento o cultivo. Se desarrollarán metodologías específicas de Q-PCR absoluta para cada uno de los principales patógenos identificados (protozoos, bacterias patógenas y virus), metodologías que serán validadas y estandarizadas en base a técnicas de diagnóstico clásico.

Se utilizarán también muestras de hemolinfa extraída con un simple pinchazo para la validación de parámetros de respuesta inmune. Se analizará la expresión de genes de respuesta inmune, seleccionados a partir de resultados transcriptómicos previos, para su validación como indicadores de bienestar y salud.

Los resultados que se obtengan pretenden ser una herramienta fundamental para el incipiente desarrollo de la acuicultura sostenible de pulpo común.

 Requisitos: Las personas solicitantes deben estar cursando un título de Grado o Máster y cumplir con todos los requisitos contemplados en la convocatoria.

Grupo: Procesos Oceánicos en Cambio Global

Área: Vida  Referencia da oferta: JAEINT24_EX_1663

Contacto: Miguel Gil Coto

No marco do proxecto de investigación STRAUSS (Efectos das Ondas do Océano no Sistema de Afloramento das Rías Baixas: dinámica da superficie en estudos biolóxicos seleccionados), o IIM-CSIC desenvolveu dous dispositivos para medir o movemento de alta frecuencia de bóias e bateas de mexillón. Ambos dispositivos electrónicos usan Unidades de Medición Inercial (IMU) implementadas nunha plataforma Arduino con capacidades de rexistro e transmisión de datos (GPRS).

Esperamos mellorar os algoritmos e os pasos de procesamento de datos necesarios para transformar os sinais da IMU nos parámetros das ondas oceánicas e os movementos das bateas de mexillón (que, en última instancia, producen desprazamentos de mexillón) coa bóia e os dispositivos de balsa de mexillón, respectivamente.

Pretendemos coñecer os réximes de ondas nas Rías Baixas e o seu efecto na dinámica actual e o seu impacto no ecosistema.

Requisitos: Las personas solicitantes deben estar cursando un título de Grado o Máster y cumplir con todos los requisitos contemplados en la convocatoria.

Grupo: Procesos Oceánicos en Cambio Global

Área: Vida  Referencia da oferta: JAEINT24_EX_1558

Contacto: Carmen González Castro

Las zonas costeras son una frontera entre los sistemas terrestre, oceánico y atmosférico por lo que en ellas se produce un intenso gradiente tanto de energía, como de materia. Una de las singularidades de las zonas costeras es su proximidad con el sedimento, que hace que los procesos de interacción con esta frontera se vean favorecidos y juegan un papel clave en el ciclo del carbono a escala global.

Por ello, para entender el funcionamiento de estos ecosistemas costeros es crítico conocer el metabolismo bentónico de los mismos, es decir el balance entre producción primaria y la respiración total en esta capa límite bentónica. Los métodos más utilizados para cuantificar in situ el metabolismo del lecho marino han sido las mediciones de cámaras bentónicas y microperfiles, principalmente aplicados a sedimentos cohesivos.

Sin embargo, en la última década el método de eddy covariance se ha utilizado ampliamente debido a su mayor resolución espacial y temporal (Berg et al., 2003). No es una técnica invasiva y puede emplearse tanto en ambientes con sedimentos cohesivos como sedimentos permeables. La técnica deriva los flujos bentónicos de O2 a partir de registros simultáneos de velocidad vertical y de concentración de oxígeno en un volumen dado de agua. Para ello es necesario medidas de alta frecuencia (>32Hz), empleándose un ADV (Acoustic Doppler Velocimeter) para velocidades y un optode de alta frecuencia para concentraciones de O2. De este modo se puede obtener el flujo por movimiento turbulento y de ahí el trasporte neto de O2 hacia el sedimento.

El objetivo principal de esta propuesta es cuantificar el metabolismo neto bentónico a partir de mediciones de flujo de oxígeno aplicando la técnica de eddy covariance. Para ello se plantea que el/la candidato/a reanalice los datos de los fondeos del sistema ADV-O2 optode obtenidos en diferentes muestreos en las Rías Baixas y si el tiempo lo permite, participe y analice datos de un fondeo del sistema ADV-O2.

Como resultados del proyecto se espera que el/la candidato/a adquiera los conocimientos para desarrollar su trabajo de fin de master. El plan de trabajo consiste (1) Período inicial conocimientos y procesamiento de datos para cómputo de flujos bentónicos. (2) Realización de un fondeo adicional in situ (3) Redacción de la memoria.

Requisitos: Las personas solicitantes deben estar cursando un título de Grado o Máster y cumplir con todos los requisitos contemplados en la convocatoria.

Grupo: Bioquímica de Alimentos

Supervisores: Ricardo I. Pérez Martin, Maria Blanco & Carmen Glez Sotelo

Área: Vida  Referencia da oferta: JAEINT24_EX_1598

Contacto: Carmen González Sotelo

El proyecto pretende que el alumno adquiera conocimientos sobre el desarrollo y puesta a punto de procesos de valorización de descartes y subproductos de la pesca utilizando metodologías de bajo impacto ambiental a partir de subproductos de pescado, en concreto el trabajo está enfocado a la obtención de colágeno y se enmarca en un proyecto de colaboración internacional WASTE2TASTE (programa “Sustainable Blue Economy Partnership” SBEP).

El programa formativo incluye cuatro objetivos:

1. Conocer las características de los subproductos mediante un análisis de las características de los subproductos ricos en colágeno que se producen tanto a nivel industrial como por parte de los minoristas. Con este objetivo el candidato se familiarizará con entornos industriales y obtendrá una idea global del problema de la generación y gestión de este tipo de residuos. Además, conocerá las principales técnicas analíticas que se utilizan para su caracterización fisicoquímica en el laboratorio.
2. Conocer los procesos tanto tradicionales como aquellos de bajo impacto ambiental (extracción supercrítica, microondas o ultrasonidos) que se diseñarán en el proyecto para la obtención de colágeno a partir de los subproductos seleccionados.
3. Aprendizaje de métodos de evaluación de los procesos empleados en la extracción de colágeno, tales como análisis de rendimientos, tiempos de extracción y características fisicoquímicas del colágeno obtenido: determinación de la masa y estructura molecular mediante cromatografía de permeación en gel (GPC) e intercambio iónico (SAX-HPLC), electroforesis SDS-PAGE, microscopía, espectroscopía FTIR y difracción de rayos X (XRD); determinación de aminoácidos por HPLC.
4. Aprender a obtener información científica, analizar datos, redactar informes y participar en reuniones científicas .

Requisitos: Las personas solicitantes deben estar cursando un título de Grado o Máster y cumplir con todos los requisitos contemplados en la convocatoria.

Grupo: Ecología y Recursos Marinos

Área: Vida  Referencia da oferta: JAEINT24_EX_ 0476

Contacto: Jorge Hernández Urcera

El plan de formación está enfocado en el estudio de la ecología y comportamiento de cefalópodos en su hábitat natural. El alumno/a tendrá la oportunidad de abordar diferentes aspectos de la ecología de los cefalópodos, una clase de animales con una excepcional capacidad para desarrollar una amplia gama de comportamientos. Su impresionante capacidad neuronal modula estratégicamente el cerebro, los brazos y la piel, configurando un comportamiento sincronizado que permite a estos invertebrados encontrar la mejor manera de sobrevivir y perpetuar la especie. Muchos de estos comportamientos, que juegan un papel clave en la ecología de estas especies, ya han sido descritos gracias principalmente a experimentos realizados en cautividad, pero muchos otros están a la espera de ser descubiertos por la ciencia. Recientemente, la ciencia ciudadana ha adquirido un papel fundamental para abordar cuestiones de investigación inalcanzables a través de proyectos científicos convencionales. Aprovechando esta nueva ventana de investigación, hemos potenciado y aumentado exponencialmente nuestra capacidad para conseguir material audiovisual con el que explorar comportamientos de cefalópodos que permanecen ocultos en el ámbito marino.

Actualmente contamos con la colaboración de varios científicos ciudadanos, principalmente buceadores recreativos y fotógrafos submarinos, que nos están proporcionando material de alto valor científico para explicar interesantes comportamientos de sepias, pulpos y calamares. Por medio de la curación y tratamiento de estos datos, el/la estudiante abordará diferentes aspectos de la ecología y el comportamiento de estas especies, como la cópula, la depredación, la alimentación, las relaciones interespecíficas, etc.

Asimismo, el/la estudiante podría participar en salidas de campo dedicadas al estudio de cefalópodos en su medio natural. El objetivo del plan de formación es el análisis de toda esta información para situarla en un contexto ecológico, pudiendo así definir las estrategias utilizadas por estos animales para sobrevivir en un medio tan hostil.

El proyecto formativo constará de tres etapas:

1. visualización y curación del banco de imágenes de cefalópodos 
2. Análisis de la información relevante registrada
3. Definición de nuevos comportamientos de las especies estudiadas. Los resultados del proyecto formativo podrían dar lugar a publicaciones científicas, que repercutirían de forma notable en la formación científica del candidato/a.

Requisitos: Las personas solicitantes deben estar cursando un título de Grado o Máster y cumplir con todos los requisitos contemplados en la convocatoria.

Grupo: Procesos Oceánicos en Cambio Global

Área: Vida  Referencia da oferta: JAEINT24_EX_1214

Contacto: María López Acosta

Las esponjas juegan un papel fundamental en los ecosistemas marinos, contribuyendo a la conservación de la biodiversidad y la salud de los océanos. Estos organismos son clave en el reciclaje de nutrientes como el silicio, conectando los procesos ecológicos y biogeoquímicos que tienen lugar en el fondo marino con los que ocurren en la columna de agua.

Las esponjas se consideran potenciales "ganadoras" frente al cambio climático, debido a su aparente resistencia comparativa a condiciones como el calentamiento y la acidificación. Sin embargo, los mecanismos que les permiten tolerar estas nuevas condiciones siguen siendo en gran parte desconocidos. En el marco del proyecto SPICA (SPonge Interplay in the biogeochemical cycle of silicon in the era of Climate chAnge), mediremos los efectos de los factores estresantes del cambio climático sobre la ecofisiología y biogeoquímica del silicio en las esponjas. Paralelamente a medidas de alta frecuencia de los estresores climáticos en las Rías gallegas y a la estimación de la biomasa y distribución de estos organismos en este ecosistema, realizaremos una primera estimación del efecto del cambio climático en la supervivencia de las esponjas y su participación en el reciclado de silicio.

La persona seleccionada tendrá la oportunidad de adquirir competencias en diversas disciplinas, incluyendo biogeoquímica, fisiología animal y ecología marina. En particular, la persona seleccionada adquirirá habilidades en el manejo de equipos de muestreo y medición de pH, nutrientes, entre otros, en agua de mar. Asimismo, adquirirá competencias en métodos analíticos para determinar cambios físicoquímicos en los esqueletos silíceos de las esponjas, participará en la incubación y experimentación con esponjas en acuarios, y aprenderá herramientas de monitorización de comunidades bentónicas, como la fotogrametría.

La persona seleccionada también desarrollará competencias en el análisis e interpretación de datos, participando en la generación de resultados inéditos que serán compartidos con la comunidad científica mediante su publicación en revistas y conferencias especializadas.

Requisitos: Las personas solicitantes deben estar cursando un título de Grado o Máster y cumplir con todos los requisitos contemplados en la convocatoria.

Grupo: Procesos Oceánicos en Cambio Global

Área: Vida  Referencia da oferta: JAEINT24_EX_ 0583

Contacto: Marcos Fontela

Según el último informe del IPCC, para limitar el calentamiento global por debajo de 2 °C para 2100, será necesaria la eliminación del dióxido de carbono (CDR) de la atmósfera. La mejora de la alcalinidad del océano (OAE) es una prometedora técnica de CDR marina basada en el proceso de erosión natural que tiene el mayor potencial general entre todas las demás tecnologías de CDR marinas propuestas hasta la fecha.

Esta adición de alcalinidad es capaz de neutralizar más CO₂ presente en el agua y más CO₂ que se absorbe de la atmósfera. Además, agregar alcalinidad no sólo permite que el océano almacene más carbono antropogénico, sino que también mejora la acidificación del océano, aumentando el pH del agua de mar y el estado de saturación de carbonato de calcio.

Por lo tanto, junto con la urgencia de mitigar el cambio climático, existe la necesidad de comprender la eficiencia potencial, la seguridad ambiental y la viabilidad del monitoreo de la OAE como técnica. Aquí proponemos un enfoque interdisciplinario integrado.

Esta investigación llevará a cabo experimentos de microcosmos de la OAE con comunidades de plancton in situ para abordar los objetivos de la investigación. Brevemente, se aplicará el mismo tratamiento de adición de alcalinidad a dos escenarios diferentes: desequilibrado y equilibrado. El escenario desequilibrado simulará el hecho de que la entrada de CO2 aún no se ha producido justo después de la adición de alcalinidad, y el escenario equilibrado donde el agua de mar con alcalinidad mejorada ya ha equilibrado el CO2 con la atmósfera. La adición de alcalinidad será la misma: +500 µmolkg-1.

Además, habrá un microcosmos de control sin alcalinidad añadida. Se monitorearán diariamente un total de 9 microcosmos (3 réplicas por escenario) durante tres semanas. Se recuperarán de forma programada mediciones de parámetros biogeoquímicos y muestras de alcalinidad total, pH, salinidad, luz, temperatura, nutrientes inorgánicos, clorofila a, partículas de carbono orgánico, sílice biogénica, citometría de flujo, microscopía y muestras de ADN. Se prestará especial atención al establecimiento de metodologías estándar y rentables que garanticen la reproducibilidad y la intercomparación.

La persona candidata recibirá capacitación en configuración de microcosmos, procesamiento multidisciplinario de muestras y análisis de química del carbono inorgánico.

Requisitos: Las personas solicitantes deben estar cursando un título de Grado o Máster y cumplir con todos los requisitos contemplados en la convocatoria.

Grupo:  Inmunología y Genómica

Área: Vida  Referencia da oferta: JAEINT24_EX_1659

Contacto: Beatriz Novoa García

El objetivo de este proyecto EoI es estudiar las bases moleculares de la respuesta antiviral utilizando el pez cebra (Danio rerio) como modelo. Nuestro objetivo es comprender cómo aspectos intrínsecos del cuerpo, como la inflamación o el microbioma, pueden afectar la resistencia a las enfermedades virales.

La persona candidata utilizará herramientas de biología e inmunología celular, así como herramientas transcriptómicas (RNA seq) y diversas herramientas bioinformáticas para analizar la modulación de la respuesta inflamatoria y antiviral de macrófagos y neutrófilos a las infecciones.

Se estudiará el papel de diferentes genes en la respuesta inmune innata, principalmente aquellos con relevancia en enfermedades inflamatorias humanas, bloqueando o aumentando temporalmente su expresión.

Requisitos: Las personas solicitantes deben estar cursando un título de Grado o Máster y cumplir con todos los requisitos contemplados en la convocatoria.

Grupo: Inmunología y Genómica

Área: Vida  Referencia da oferta: JAEINT24_EX_1664

Contacto: Patricia Pereiro González

Este plan de trabajo tiene como objetivo estudiar las bases moleculares de la posible implicación del metabolismo, y por tanto de diferentes metabolitos, en la respuesta inmune de peces de interés comercial, como el rodaballo (Scophthalmus maximus) y la lubina (Dicentrarchus labrax), frente a diferentes patógenos. .

La inmunometabolómica es un área de investigación emergente que estudia la interacción del metabolismo y la inmunidad, dos disciplinas consideradas independientes hasta hace relativamente poco tiempo. De hecho, el término inmunometabolismo fue acuñado en 2011 por dos investigadores de la Universidad de Harvard y desde entonces este nuevo enfoque ha experimentado numerosos avances.

Ahora se sabe que ambos sistemas interactúan, tanto a nivel celular como sistémico, para responder a las infecciones de la forma más eficaz posible. Por otro lado, muchos patógenos han adquirido la capacidad de manipular el metabolismo del huésped para favorecer su propia propagación. Es por ello que este nuevo enfoque puede aportar información muy valiosa con potenciales aplicaciones para reducir el impacto de las enfermedades infecciosas en el campo de la acuicultura.

Las personas interesadas ​​se formarán en técnicas de secuenciación masiva y análisis metabolómicos, que son la base para identificar las rutas y metabolitos implicados en la respuesta inmune o en la mayor o menor resistencia a enfermedades infecciosas, y pruebas funcionales encaminadas a comprobar el posible efecto inmunomodulador de diferentes Se llevarán a cabo metabolitos, hormonas metabólicas o compuestos reguladores metabólicos.

La especie modelo pez cebra (Danio rerio) también se utilizará para la selección preliminar de posibles compuestos candidatos para aplicarlos posteriormente a especies comerciales. Se realizarán análisis bioinformáticos, técnicas de biología molecular (extracción de ácidos nucleicos, síntesis de ADNc, PCR en tiempo real...) y técnicas de microscopía, entre otras.

Requisitos: Las personas solicitantes deben estar cursando un título de Grado o Máster y cumplir con todos los requisitos contemplados en la convocatoria.

Grupo: Ecología y Recursos Marinos

Área: Vida  Referencia da oferta: JAEINT24_EX_1453

Contacto: Jose Pintado Valverde

El kombu de azúcar (Saccharina latissima) es una especie prometedora en la acuicultura europea de algas, con gran potencial en su utilización en sistema de acuicultura multitrófica integrada (AMTI), asociada a cultivo de mejillón (Mytilus galloprovincialis), sirviendo para la captación de nutrientes y mitigando el impacto ambiental.

Las comunidades bacterianas asociadas a macroalgas desempeñan un papel determinante en la fisiología del alga, considerándose esta y su microbiota asociada como una entidad funcional singular u holobionte. En este contexto, el conocimiento de las comunidades bacterianas puede ser crítico en la acuicultura de algas marinas para establecer condiciones que eviten fenómenos de disbiosis y asegurar la salud de las algas.

La formación estaría relacionada con la línea de investigación en curso, dirigida al estudio de modelos piloto de sistemas de AMTI con enfoque ecosistémico, y se centraría en el estudio del microbioma de kombu de azúcar en un sistema AMTI en el mar, asociada a cultivos de mejillón en batea. Se estudiarán las comunidades microbianas en el germoplasma de S. latissima utilizado para la siembra de los sistemas de cultivo en long-line, así como su evolución en los cultivos a diferentes tiempos. Se llevará a cabo asimismo un estudio comparativo con ejemplares silvestres en la misma zona.

El análisis de las comunidades bacterianas epifitas del alga se analizará a partir de la extracción del ADN bacteriano obtenido de la superficie de alga, y amplificación de la región V4 del gen ARNr 16S, analizado posteriormente mediante secuenciación Miseq (Illumina). Así, la estancia de formación permitirá al solicitante iniciarse en la actividad investigadora, familiarizándose con diferentes aspectos teóricos y técnicos de cultivo de macroalgas, de microbiología, de análisis molecular y bioinformática, relacionados con la línea de trabajo en curso, contribuyendo a la comprensión de las interacciones microbianas en la acuicultura de algas y sus implicaciones para los sistemas AMTI.

Requisitos: Las personas solicitantes deben estar cursando un título de Grado o Máster y cumplir con todos los requisitos contemplados en la convocatoria.

Grupo: Biosistemas e Ingeniería de Bioprocesos

Área: Vida  Referencia da oferta: JAEINT24_EX_0519

Contacto: Miriam Rodríguez García

La "microbiología predictiva" es una disciplina centrada en el modelado matemático de la dinámica de los microorganismos relevantes para la calidad y seguridad de los alimentos. Si bien las estructuras matemáticas son conocidas (ver por ejemplo el modelo de Baranyi), la calibración de estos modelos con datos experimentales presenta una serie de dificultades que deben abordarse utilizando los conceptos de estimación e identificación de parámetros para sistemas no lineales que hemos estado estudiando en nuestro estudio. grupo desde hace años

En estos meses de formación se estudiará cómo la alta incertidumbre/variabilidad en los datos experimentales de crecimiento e inactivación bacteriana impacta en la incertidumbre de las predicciones de los modelos matemáticos. Este análisis permitirá responder a las siguientes preguntas de alta relevancia para el desarrollo de la microbiología predictiva:

1. ¿Podemos predecir el crecimiento bacteriano en los alimentos a partir de modelos matemáticos calibrados utilizando datos experimentales estándar de curvas de crecimiento e inactivación sujetas a una alta incertidumbre/variabilidad?
2. ¿Podemos definir límites a la incertidumbre en los experimentos para garantizar predicciones útiles?
3. ¿Cuáles son los mejores métodos para calibrar modelos de dinámica bacteriana con datos sujetos a alta variabilidad?

Puedes encontrar más información sobre nuestro grupo en el sitio web de Bio2Eng.

Requisitos: Las personas solicitantes deben estar cursando un título de Grado o Máster y cumplir con todos los requisitos contemplados en la convocatoria.

Grupo: Laboratorio de Biotecnología Acuática

Área: Vida  Referencia da oferta: JAEINT24_EX_1367

Contacto: David Saque Henriques

En el campo de la acuicultura, las anomalías del desarrollo de los peces plantean desafíos importantes para la eficiencia de la producción y afectan tanto la eficiencia animal como la eficiencia animal. bienestar Para abordar estos desafíos es fundamental una comprensión profunda del desarrollo pesquero. Dada la naturaleza dinámica del desarrollo, aprovechar las técnicas de aprendizaje automático junto con el modelado dinámico es una vía prometedora para resolver problemas críticos en la acuicultura.

El pez cebra se ha convertido en un modelo vital para los estudios del desarrollo de los vertebrados debido a su similitud genética con otros vertebrados y su etapa embrionaria transparente. Su uso en el contexto de la acuicultura es invaluable para examinar procesos fisiológicos y vías de desarrollo.

Este proyecto de maestría se centrará en dos tipos de células que se sabe que están asociadas con anomalías del desarrollo en peces de cultivo: osteocitos y cromatóforos. Los osteocitos desempeñan un papel crucial en la formación y el mantenimiento de los huesos, mientras que los cromatóforos son células que contienen pigmentos esenciales para el color. Las aberraciones en el desarrollo de estas células pueden provocar deformidades esqueléticas y trastornos de pigmentación, respectivamente.

En este proyecto, el/la candidato/a utilizará un enfoque combinado de biología de sistemas y aprendizaje automático para realizar ingeniería inversa en redes de diferenciación celular a partir de datos de transcriptómica unicelular.

Los objetivos de la persona estudiante interesada en este proyecto serán:

1. Utilizando un estudio publicado sobre el desarrollo embrionario, identificará células maduras y las rastreará hasta sus progenitores con la ayuda de algoritmos de análisis pseudotemporales. Este procedimiento descubrirá los factores de transcripción clave y las vías de señalización que impulsan la diferenciación celular.
2. A partir de la información bibliográfica y de los datos de transcriptómica unicelular, el estudiante construirá una red cualitativa inicial de regulación de la diferenciación.
3. Finalmente, para aprovechar el poder de la biología de sistemas y el aprendizaje automático, este proyecto utilizará SELDOM, una herramienta de software que opera en el nexo de estos campos. SELDOM es experto en la construcción de modelos de conjuntos dinámicos que representan la complejidad de las redes reguladoras de genes. Estos modelos son fundamentales para simular las interacciones genéticas que impulsan el proceso de diferenciación celular y ofrecen una mejor comprensión de la biología del desarrollo.

El proyecto tiene como objetivo mejorar la comprensión de la fisiología de los osteocitos y cromatóforos y allanar el camino para innovaciones en el seguimiento de anomalías del desarrollo en peces de cultivo.

Requisitos: Las personas solicitantes deben estar cursando un título de Grado o Máster y cumplir con todos los requisitos contemplados en la convocatoria.

Grupo: Laboratorio de Biotecnología Acuática

Área: Vida  Referencia da oferta: JAEINT24_EX_0999

Contacto: María Saura Alvarez

La presente propuesta responde a la motivación por profundizar en el conocimiento sobre la base genética que subyace a la resistencia a enfermedades en la acuicultura, con el objetivo de incorporar de manera eficiente este carácter complejo en los esquemas de selección genética. La investigación actual indica que la microbiota intestinal desempeña un papel fundamental en la modulación del sistema inmune.

Este proyecto busca aportar una nueva perspectiva al estudio de la resistencia a enfermedades en la acuicultura mediante la aplicación de enfoques metagenómicos. Para llevar a cabo este propósito, se ha llevado a cabo un experimento de infección con la bacteria Yersinia ruckeri, utilizando una muestra de 200 individuos (100 controles y 100 enfermos). Además, se dispone de datos de expresión de ARN en el intestino, que se integrarán con los datos del microbioma. Estos datos de ARN proporcionarán información adicional sobre los mecanismos moleculares subyacentes a la respuesta inmune de los peces y su relación con la diversidad y abundancia de especies de la microbiota.

El análisis de los perfiles taxonómicos de variación y abundancia de la microbiota en peces sanos e infectados, junto con los datos de expresión de ARN, permitirá obtener una comprensión más completa de la influencia de la microbiota intestinal en el estado de salud de los peces. Se explorará el potencial de aplicación de este conocimiento para mejorar la respuesta del huésped a la enfermedad, ya sea mediante la selección de individuos con perfiles microbianos específicos o mediante la administración de probióticos.

Se espera que los resultados obtenidos no solo contribuyan a optimizar los programas de mejora genética en la acuicultura, sino también a sentar las bases de futuras investigaciones sobre la interacción entre los genomas de la microbiota y del huésped, así como sobre los mecanismos moleculares implicados en la respuesta inmune de los peces. Este enfoque integrador promete impulsar significativamente el avance del conocimiento en el campo de la salud y la producción en la acuicultura.

Requisitos: Las personas solicitantes deben estar cursando un título de Grado o Máster y cumplir con todos los requisitos contemplados en la convocatoria.

Grupo:Laboratorio de Biotecnología Acuática

Área: Vida  Referencia da oferta: JAEINT24_EX_1260

Contacto: Josep Rotllant Moragas

Los microARNs circulantes (C-miARNs) son pequeñas moléculas de ARN no codificante altamente conservadas que orquestan una amplia gama de procesos biológicos a través de la regulación post-transcripcional de la expresión génica. Un aspecto interesante de la identificación de estas moléculas como biomarcadores proviene de expresión tanto temporal como espacial finamente regulada, su secreción desde las células al medio extracelular y su alta estabilidad en los fluidos corporales.

Todas estas características confieren a los C-miRNA el potencial de convertirse en una valiosa herramienta no invasiva para medir el bienestar y la salud de los animales. Por tanto, existe un gran interés en el estudio de la importancia de los C-miRNAs como posibles biomarcadores para evaluar el bienestar durante los procesos de domesticación y cultivo de una determinada especie.

En este trabajo pretendemos mapear, caracterizar y establecer diferentes C-miRNAs en diferentes tejidos del pulpo común para ser usados como biomarcadores para la evaluación del estado de salud y bienestar de esta especie en poblaciones naturales y en el proceso de su domesticación y producción en sistemas de cultivo intensivo.

Requisitos: Las personas solicitantes deben estar cursando un título de Grado o Máster y cumplir con todos los requisitos contemplados en la convocatoria.